GIGABYTEのマザーが届いたので入れ替えました。コンデンサも届いてたので修理して？と思ったけど、復旧を優先したので、マザーのみ交換です。さすがに同じ会社で同じチップのマザーなのでXPを起動してもアクチベーションも必要とせず問題なく動作しました。過去の設定が残ってたのかアクチ不要ってのはいいです。
動かしてたらまた電源が落ちました。ケース内の熱が結構こもってシャットダウンされたみたい。ケースをあけて、扇風機で風を直接CPUとグラフィックボードにあたるようにして一晩動かしてみたら問題なく動いてました。これで復帰です。
結構音を出さないようにクーラーを工夫してたのですが、グラフィックカードをパワーのある奴に置き換えてから熱のバランスが崩れてたのも要因の１つかも。電源も一度交換してるので、排気ファンとしても弱くなったのかも。次は音を考慮しつつファンまわり交換か。