vmware-playerを入れようと思ったらhttp://bugs.gentoo.org/281011ここのエラーと同じ現象が出た。Python関係のパッケージでsetuptoolsの特定バージョン以外で起きてるみたい。うちは何も考えずに最新を入れてましたが問題があるみたいで、問題ないバージョンを入れたらコンパイルが通りました。lxmlさえ入ればあとは最新にしてもいいような気がするのでひとまずこのままいきます。