やっと終わった。
いくつかのパッケージでlafilefixerを実行しないと駄目なのがあったのと、libpng12問題があったくらいか。前者は古いパッケージが引き起こす問題か?一通りlaを提供するパッケージを更新してくれればいいのにね。後者は付属のシェルスクリプトを実行すれば解消できる。一応古いライブラリは新パッケージの持ち物らしいから消さないけどリンク先が新しいものになってるからこのまま放置でいいかも。
見た目の問題点はなかったけど、Firefoxを起動すると最新じゃないって警告画面が出てた。最新じゃないとしても閲覧できればいいのでこれも放置。ローカルの設定を消せば解決できるのか?とか思うけど面倒なのでいいや。